W 1966 klub powrócił do nazwy Universitatea. Na koniec sezonu 1971/72 Universitatea znalazła się na trzeciej pozycji w tabeli Divizia A – było to najlepsze miejsce od chwili zakończenia II wojny światowej (Universitatea zdobyła tyle samo punktów co wicemistrz Rumunii UT Arad). Kolejny raz Universitatea zaprezentowała się w europejskich pucharach w Pucharze UEFA w sezonie 1972/73. W pierwszej rundzie Universitatea pokonała u siebie 4:1 bułgarski klub Lewski Spartak Sofia. Pomimo wysokiego zwycięstwa nie udało się awansować do drugiej rundy – w Sofii w normalnym czasie było 1:4 dla Lewskiego. W dogrywce drużyna bułgarska zdobyła piątą bramkę i wyeliminowała Universitateę z turnieju.

W 1998 Universitatea dotarła do finału Pucharu Ligi (Cupa Ligii), gdzie przegrała z FCM Bacău.

W 1999 Universitatea spadła do drugiej ligi rumuńskiej (Divizia B), a w 2000 pierwszy raz w swych dziejach spadła do trzeciej ligi (Divizia C), w której zagrała jednak tylko jeden sezon, po którym wróciła do drugiej ligi. Trenerem drużyny był były reprezentant Rumunii Ioan Sabău, który w początkach swej piłkarskiej kariery w latach 80. grał w klubie Universitatea.