Linia kolejowa do Międzychodu była czynna do ruchu osobowego do roku 1987, natomiast ruch towarowy zawieszono w 1992 roku. W lutym 2005 w Zbąszyniu rozebrano rozjazd odgałeziający na Międzychód, a większość torów rozkradziono.
W latach 1928-1929 wybudowano obok starego budynku nowy budynek dworcowy z halą rewizyjną w stylu modernistycznym według projektu architektonicznego Adolfa Pillera. Powstał on ramach przygotowań do Powszechnej Wystawy Krajowej w Poznaniu i związanym z nią przewidywanym wzmożonym pasażerskim ruchem granicznym z Niemiec oraz powiązanymi z tym również kwestiami o charakterze reprezentacyjno-prestiżowymi, gdyż jak pisano wówczas w branżowym miesięczniku Inżynier Kolejowy z września 1929 roku (styl zapisu oryginalny):Stosunki na dworcu w Zbąszyniu panujące nie licowały z powagą naszego Państwa. Cały ruch pasażerski zagraniczny odbywał się w baraku na prędce skleconym, który wprawdzie przed trzema laty został wewnątrz otynkowany i odświeżony, lecz mimo wszystko przedstawiał bardzo prymitywne prowizorjum.Decyzją Ministra Komunikacji z września 1928 roku wydano Dyrekcji Kolei Państwowych w Poznaniu upoważnienie na wybudowanie nowego dworca w Zbąszyniu.