Okręt został obsadzony przez personel US Navy, ale wszyscy członkowie otrzymali dokumenty marynarzy floty handlowejQ-SHIPS VERSUS U-BOATS: America's Secret Project, Kenneth M. Beyer, Naval Institute Press, 1999.. Okręt pływał w pobliżu zachodniego wybrzeża USA jako wabik mający zwrócić uwagę wrogich okrętów podwodnych. Podobnie jak inne statki-pułapki przewoził puste beczki na ropę i drewno udające ładunek oraz zapewniające dodatkową pływalność w razie storpedowania. "Anacapa" nie odniosła sukcesów w prowokowaniu japońskich okrętów podwodnych. 6 października 1943 okręt ratował rozbitków ze storpedowanego przez okręt podwodny I-25 zbiornikowca „Larry Doheney” w pobliżu Mendocino. Sądzi się także, że uszkodził dwa własne okręty podwodne bombami głębinowymi, gdy te niezgodnie z planami operowały w jego obszarze działania. Podczas patroli służył także jako okręt rozpoznania meteorologicznego.
W październiku 1943 roku US Navy zakończyło wykorzystywanie statków-pułapek. Służył do końca wojny jako uzbrojony transportowiec. Uzbrojenie zredukowano do czterech dział plot. kalibru 76 mm i pięciu 20 mm.