W granicach administracyjnych portu znajduje się akwatorium o powierzchni 0,1112 km²(§ 12.) Zarządzenie Nr 2 Dyrektora Urzędu Morskiego w Szczecinie z dnia 3 czerwca 2002 r. (Dz. Urz. Woj. Zachodniopomorskiego z 2002 r. Nr 38, poz. 798).

Warunki nawigacyjne thumb|left|160px|Kapitanat Portu Trzebież thumb|160px|Port rybacki

W porcie Trzebież obowiązują następujące zasady ruchu statków(§58. Przepisy portowe) Zarządzenie Nr 3 Dyrektora Urzędu Morskiego w Szczecinie z dnia 26 lipca 2013 r. (Dz. Urz. Woj. Zachodniopomorskiego z 2013 r., poz. 2932): maksymalna długość statków mogących zawijać do portu wynosi 90 m, a maksymalna szerokość – 20 m, w celu uzyskania zezwolenia na wejście lub wyjście z portu statki oraz zestawy holownicze obowiązane są nawiązać łączność z Kapitanatem Portu Trzebież z 30-minutowym wyprzedzeniem, w przypadku braku pływającego oznakowania nawigacyjnego, żegluga może odbywać się tylko w porze dziennej, aktualne dopuszczalne zanurzenie statków określa kapitan portu Trzebież, warunki wejścia i wyjścia z portu statków o długości ponad 75 m lub szerokości ponad 13 m oraz wszystkich statków przy sile wiatru powyżej 6°B, każdorazowo określa Kapitan Portu Trzebież.

thumb|left|160px|Nabrzeże tranzytowe w porcie