Dupin mówi narratorowi, że prefekt jest „za sprytny na to, aby być głębokim”, ale zarazem chwali umiejętność prefekta, by de nier ce qui est, et d‘expliquer ce qui n‘est pas (cytat z Nowej Heloizy: „zaprzeczać temu, co jest, a wyjaśniać to, czego nie ma”).
Tematy i analiza thumb|Ilustracja Zabójstwa przy Rue Morgue autorstwa Aubreya Beardsleya W liście do swego znajomego, dra Josepha Snodgrassa, Poe wyjaśniał, że przewodnim tematem noweli było ćwiczenie pomysłowości w rozwiązaniu zagadki morderstwa. Dupin nie jest zawodowym detektywem; podejmuje się rozwiązania sprawy zabójstw przy Rue Morgue wyłącznie dla własnej przyjemności. Pragnie odkryć prawdę i oczyścić z zarzutów niesłusznie oskarżonego mężczyznę. Jego zaangażowanie nie ma podłoża finansowego — odrzuca nawet nagrodę od właściciela orangutana. Ujawnienie tożsamości prawdziwego zabójcy w zasadzie unieważnia przestępstwo, gdyż ani orangutan, ani jego właściciel nie mogą być moralnie odpowiedzialni za zbrodnię.