W grudniu 2011 roku pojawił się darmowy utwór do pobrania zatytułowany „Free Christmas”, a album Boomslang został ponownie wydany w 2024 roku.
7 Worlds Collide (2001–2009) Marr wykonał dwie piosenki The Smiths oraz muzykę innych artystów z supergrupą o nazwie , w skład której wchodzili członkowie Pearl Jam, Radiohead, Split Enz i innych grup. Zespół utworzył przez Neil Finn ze Split Enz i Crowded House w 2001 roku. Drugi zestaw koncertów odbył się w grudniu 2008 i styczniu 2009 roku, a w sierpniu tego samego roku wydano album z materiałem studyjnym zatytułowany , aby zebrać pieniądze dla Oxfam.
Modest Mouse (2006–2009) W 2006 roku rozpoczął współpracę z Isaakiem Brockiem z Modest Mouse nad utworami, które ostatecznie znalazły się na wydanym w 2007 roku albumie zespołu . Zespół ogłosił następnie, że Marr został pełnoprawnym członkiem zespołu, a zreformowany skład intensywnie koncertował w latach 2006–2007.
Album We Were Dead Before the Ship Even Sank osiągnął pierwsze miejsce na amerykańskiej liście Billboard pod koniec marca 2007 roku. Dla Marra był to pierwszy raz, kiedy jego płyta znalazła się na pierwszym miejscu w Stanach Zjednoczonych.