Tam Nowotny zaprzyjaźnił się z Karlem Schnörrerem oraz Paulem Gallandem, młodszym bratem Adolfa Gallanda. Paul Galland zgłosił 17 zwycięstw, gdy wchodził w skład (JG 26) w bitwie o Anglię, lecz 31 października 1942 roku został zestrzelony i zginął w walce z pilotem Spitfire’a RAF-u. Po ukończeniu Jagdfliegerschule 5, Nowotnego przydzielono 16 listopada 1940 do I Myśliwskiej Grupy Zapasowej (niem. Ergänzungs-Jagdgruppe) w Merseburgu, która miała zapewniać osłonę lotniczą zakładów przemysłowych w Leunie.
Jagdgeschwader 54 mały|lewo|Focke-Wulf Fw 190A-4 JG 54. 1 grudnia 1940 Nowotnego przydzielono do Klucza Zapasowego (niem. Ergänzungs-Staffel) (JG 54). W owym czasie JG 54 dowodził major . Nowotnemu po raz kolejny zmieniono przydział, tym razem wysłano go do 9 Eskadry JG 54 (9/JG 54), tak zwanej Teufelsstaffel (Diabelskiej eskadry), gdzie kontynuował trening pod okiem frontowych weteranów (23 lutego 1941 – 25 marca 1941). Od 25 marca 1941 do 10 marca 1942 latał w Grupie Zapasowej JG 54, gdzie 1 kwietnia 1941 roku dosłużył się stopnia podporucznika, ze starszeństwem od 1 lutego 1941.