Na początku 1948 określono granice strefy nadgranicznej na terenie województwa gdańskiego. Przebiegała ona na zachodzie od punktu przecięcia się granicy województwa szczecińskiego i gdańskiego z brzegiem jezioro Łebsko do granicy województwa olsztyńskiego na wschodzie. W tym okresie na całym odcinku granicy morskiej ochranianym przez oddział WOP w Gdańsku wykorzystywano 11 punktów obserwacyjnych, z których tylko 3 znajdowały się na własnych wieżach wybudowanych przez strażnice.
12 Gdański Oddział WOP rozformowany został 24 kwietnia 1948. Na jego bazie powstała 4 Brygada Ochrony Pogranicza.
Struktura organizacyjna thumb Organizacja Gdańskiego 12 Oddziału WOP w 1946 Dowództwo sztab i pododdziały dowodzenia Grupa manewrowa, a od 1947 szkoła podoficerska 19 komenda odcinka – Lębork 20 komenda odcinka – Gdańsk Wrzeszcz 21 komenda odcinka – Elbląg.
We wrześniu 1946 stan etatowy oddziału przewidywał: 3 komendy, 15 strażnic, 1548 wojskowych i 14 pracowników cywilnych. Po reorganizacji w 1947 było to: 3 komendy odcinków, 16 strażnic, 1254 wojskowych i 13 pracowników cywilnych.