Organizacja Gdańskiego 12 Oddziału WOP z 25 października 1946 Dowództwo Sztab Sekcja Operacyjna Sekcja Wyszkolenia Bojowego Sekcja Przejściowych Punktów Kontrolnych i konfliktów granicznych Referat Szyfrowy Sekcja Łączności Sekcja Ewidencyjno–Personalna Kancelaria Sztabu Pluton Ochrony Sztabu Sekcja Wywiadowcza Wydział Polityczno–Wychowawczy Szefowie Służb Sekcja Uzbrojenia Sekcja Techniczno–Morska Prokuratura Kwatermistrzostwo Ambulans Sanitarny Ambulans Weterynaryjny Kompania Łączności Oddziału Grupa Manewrowa Flotylla Ścigaczy 3 Komendy Odcinków WOP 15 Strażnic Liniowych WOP 2 Strażnice Liniowe Specjalne 2 Przejściowe Punkty Kontrolne.
Stan osobowy: oficerów – 162 podoficerów – 449 szeregowych – 937 Razem – 1548 Kontraktowych – 15.
Sąsiednie oddziały Wojsk Ochrony Pogranicza 4 Bałtycki Oddział WOP ⇔ 5 Mazurski Oddział WOP – 21.09.1946–24.04.1948.
Dowódcy oddziału ppłk Józef Hajdukiewicz (był 10.1946)Rozkaz personalny dowódcy WOP nr 062 z 19.10.1946 (). płk Karol Bacz (8.10.1946–28.05.1947).