Został zamordowany razem z rodziną Godunowych przez agentów Dymitra Samozwańca I, podającego się za cudownie ocalałego carewicza Dymitra, syna Iwana IV Groźnego. Pojawienie się Dymitra Samozwańca I w Rosji było możliwe dzięki wsparciu niektórych polskich magnatów, zakonu jezuitów i papieża, którzy zorganizowali jego wyprawę, zapewnili niezbędne środki i w znacznej mierze kierowali jego politykąAndrzej Andrusiewicz, Dzieje Wielkiej Smuty, Katowice 1999.. Dymitr Samozwaniec I panował w Moskwie przez rok, po czym zginął na skutek antypolskiego powstania wznieconego przez bojarów. Jego następcą został Wasyl IV Szujski. Na skutek kryzysu gospodarczego w Rosji doszło za jego panowania do wybuchu powstania chłopskiego Iwana BołotnikowaTomasz Bohun, Moskwa 1612, Wydawnictwo Bellona 2005 .. Podczas rozruchów społecznych pojawił się Dymitr Samozwaniec II, podający się za cudownie ocalonego Dymitra Samozwańca I. Jego zwolennicy zbrojnie wystąpili przeciwko carowi Szujskiemu. Spowodowało to podpisanie przez Szujskiego sojuszu ze Szwecją i zrzeczenie się praw do Inflant. W 1609 Rzeczpospolita Obojga Narodów wypowiedziała wojnę Carstwu Ruskiemu.