Rzadkimi drzewami w Lesie Bemowskim są: klon polny, jarzębina, jabłoń i grusza; te dwa ostatnie drzewa zapewne częściowo rozsiane przez człowieka. Zdaje się, że trzy ostatnie gatunki wiążą się z lasami grądowymi na nieco gorszych glebach. Inne niepodmokłe lasy liściaste – na gorszych glebach Lasu Bemowskiego rosną brzozy brodawkowate i dęby szypułkowe, a także osiki. Obok nich występują inne drzewa i krzewy liściaste, jak czeremcha amerykańska, jarzębina, kruszyna pospolita, głóg i porzeczka alpejska. Bory – zajmują dużą część Lasu Bemowskiego, ale przeważnie sadzone są sztucznie na nietypowych siedliskach. Są też nieustannie wypierane przez odradzający się las liściasty. Z reguły są to bory sosnowe, ale sadzono w Lesie Bemowskim również świerki. Przetrwał właściwie tylko jeden zwarty drzewostan świerkowy. W pobliżu Góry Śmieciowej znajduje się też nasadzenie modrzewia niewiadomego gatunku oraz rozproszone w lesie pojedyncze względnie stare okazy tego drzewa. Olsy – najczęściej spotykane w Lesie Bemowskim lasy bagienne. Łęgi – występują nad płynącymi przez Las Bemowski, przeważnie uregulowanymi potokami. Rosnące tu drzewa to jesion wyniosły, olcha, klon jesionolistny, czeremcha zwyczajna, topola biała, wierzba biała, niekiedy też inne drzewa.