Zamiast zamkniętych programów muzycznych powstał dzienny program „Total Show”. W programach muzycznych kanału stopniowo zwiększano liczbę klipów rosyjskich artystów pop, w tym tych, którzy lobbowali duże wytwórnie płytowe lub reklamodawców.
Po dołączeniu Ilji Baczurina do MTV Rosja, bloki muzyczne zaczęły się często zmieniać, a teledyski absolwentów projektu „Fabryka Gwiazd”, stworzone pod jego nadzorem, z czasem zaczęły być emitowane również same reality show (Kanał Pierwszy był wówczas uważany za przyjaznego partnera MTV Rosja, skąd pochodził Baczurin). Na tle odejścia pierwotnych VJ-ów jakość programów i popularność kanału zaczęły stopniowo spadać. Dodatkowo, bezpłatny czas antenowy stopniowo zaczęto przyznawać programom interaktywnym, które opierały się na głosowaniu poprzez wysyłanie wiadomości SMS na czterocyfrowy numer telefonu. W różnych okresach na antenie MTV Rosja emitowano „SMS-chart”, „Kinochart”, „Mobile Robots” itp. W latach 2004-2009 na kanale stale funkcjonowały usługi SMS do zamawiania piosenek na telefony komórkowe lub świadczenia różnych usług rozrywkowych, a także czaty wyświetlane u dołu ekranu podczas klipów i transmisji.