Po krótkiej chorobie zmarła w szpitalu w Warszawie. Została pochowana 25 września 2009 na cmentarzu ewangelicko-reformowanym w Warszawie (kwatera N-2-31)śp. BARBARA KRYSTYNA SKARGA.
Twórczość naukowa
W twórczości naukowej Barbary Skargi można wydzielić pięć kręgów problemowych, pokrywających się mniej więcej z chronologicznymi etapami jej zainteresowań filozoficznych. Pierwszy z tych etapów to badania nad pozytywizmem polskim i francuskim. W badaniach tych Barbara Skarga skupiła się nad historycznym kontekstem ideowym, w jakim rodził się polski pozytywizm, analizowała jego uwikłania w problematykę narodową i filozoficzno-historyczną, przy okazji prezentując sylwetki ideowe całej galerii ważnych dla polskiej kultury postaci. Naturalnym kolejnym krokiem naukowych poszukiwań było cofnięcie się do źródeł i podjęcie studiów nad filozofią ojca pozytywizmu, Augusta Comte’a. A po badaniach nad filozofią Comte’a przyszła jeszcze kolej na historyczną i filozoficzną analizę sporów, jakie wybuchły wśród francuskich uczniów po śmierci mistrza. Publikacja wyników wszystkich tych badań była na gruncie polskim zupełną nowością.