Nathan natychmiast wypływa z łodzi i dołącza do przyjaciela oraz złoczyńców. Po krótkiej bójce padają strzały – Sully upada na ziemię, po czym się nie rusza. Drake myśli, że ten został zabity. Szybko ucieka w głąb dżungli, a za nim podążają ludzie Romana. Po drodze spotyka Elenę, którą od razu informuje o śmierci przyjaciela. Wraz z nią wsiada do jednego z jeepów złoczyńców i ucieka.
Nathan i Elena podróżują samolotem na tajemniczą wyspę. Jednak mają awarię i są zmuszeni skakać ze spadochronami. Przez to zostają rozdzieleni. Spadochron Drake’a zahacza o drzewa i grzęźnie w nich. Drake traci przytomność, a po ocknięciu się przecina go i spada na ziemię. Podążając przez dżunglę dociera do twierdzy, do której wchodzi przez okno, wspinając się po jej ścianach nad przepaścią. W jednym z pokoi znajduje teleskop Francisa Drake’a, który okazuje się być kolejną poszlaką. Patrząc przez niego, dostrzega miejsce kolejnej wskazówki. Ponadto dostrzega także Elenę, której także nic się nie stało po katastrofie samolotu. Bohater postanawia natychmiast udać się do Eleny. Jednak po długiej wymianie ognia zostaje złapany przez piratów Eddiego Raja. Ci osadzają go w celi, z której, w trakcie rozmowy z Rają, uwalnia go Elena, rozwalając ścianę pokoju więziennego.