Powikłaniem jednego przypadku sepsy była encefalopatia.
Zapalenie rogówki Shigella flexneri jest rzadkim czynnikiem etiologicznym wrzodziejącego zapalenia rogówki; w latach 1943–2006 opisano jedynie 14 takich przypadków. Zakażenia dotyczyły młodych pacjentów (3 miesiące – 8 lat), zawsze z towarzyszącym agresywnym zakażeniem przewodu pokarmowego. Z tego powodu przy dodatniej hodowli z rogówki należy wykonać posiew kału.
Zapalenie płuc Opisano przypadki zapalenia płuc o etiologii S. flexneri u osób w złym stanie ogólnym (alkoholicy i osoby niedożywione); ma ono niepomyślne rokowanie.
Zapalenie sromu i pochwy Opisano co najmniej kilkanaście przypadków przewlekłego zapalenia sromu i pochwy u małych dziewczynek; prawdopodobnie przy współistniejącym zakażeniu przewodu pokarmowego
Rzadkie choroby Opublikowano jeden przypadek zapalenia opon mózgowych, zapalenia otrzewnej, toksycznego rozdęcia okrężnicy oraz kilka przypadków ropni – (okołonerkowy i śledziony).
Opisano również niewydolność nerek spowodowaną krążącymi kompleksami immunologicznymi oraz dwa przypadki aseptycznego zapalenia stawów jako powikłanie po infekcji tą bakterią.
Antybiotykowrażliwość Informacje ogólne Uważa się, że większość szczepów jest wrażliwa na imipenem oraz cyprofloksacynę.