Jego ulubionym autorem był Goethe.
Dorobek naukowy thumb|300px|Ilustracja z pracy Bolla o siatkówce z 1877 roku Franz Christian Boll był autorem około 20 prac, z których większość opublikowano na łamach „Archiv für Mikroskopische Anatomie” Schultzego, część ukazała się również na łamach „Archiv für Anatomie, Physiologie und wissenschaftliche Medicin” DuBois-Reymonda i Reicherta, a także w „Atti della Reale Accademia dei Lincei”.
Boll pamiętany jest głównie jako odkrywca rodopsyny. W swoich doświadczeniach wykazał, że światłoczuły barwnik w siatkówce żaby zmienia barwę na żółtą pod wpływem światła. Boll nazwał ten składnik siatkówki purpurą wzrokową (Sehpurpur). W kolejnych doświadczeniach wykazał, że barwnik występuje wyłącznie w pręcikach. Dowiódł, że barwnik może być odtwarzany, i zasugerował, że odbywa się to za pośrednictwem nabłonka siatkówki. Wyniki opublikował w artykule po włosku zatytułowanym Sull′anatomia e fistologia della retina i w listopadzie 1876 zreferował przed Akademią Berlińską, w obecności m.in. DuBois-Reymonda, Helmholtza i Pringsheima. Jako pierwszy opracował technikę uzyskiwania optogramów. Badania zapoczątkowane przez Bolla kontynuowali m.in.