Samochód otrzymał kod fabryczny W639. Gama silników została lekko zmieniona. W miejsce przedniego napędu pojawił się tylny, co poprawiło zwrotność. Poza unowocześnieniami, jak bogatsze wyposażenie i lepsze materiały wykończeniowe pojawiła się możliwość konfiguracji długości nadwozia. Dokonano podziału na wersję użytkowo-towarową, furgon towarowy, osobowy, mieszany także z wysokim dachem oraz na osobowo-luksusową pod nazwą Viano.
W 2010 roku auto przeszło facelifting. Zmieniono przednie i tylne światła, błotniki oraz przemodelowano zderzaki. Zmianie uległo także wnętrze oraz charakterystyka zawieszenia. Wprowadzono również nowe wersje silnikowe. W lipcu 2010 roku rozpoczęła się pilotażowa produkcja całkowicie elektrycznej wersji samochodu – Mercedes-Benz Vito E-Cell o zasięgu 130 km po jednym ładowaniu.
Model ten otrzymał tytuł Van of the Year 2005.
Silniki Silniki benzynowe Vito 119, 3,2 l, 140 kW (190 KM), 2003–2008 Vito 122, 3,2 l, 160 kW (218 KM), 2003–2004 Vito 123, 3,7 l, 170 kW (231 KM), 2004–2008 Vito 126, 3,5 l, 190 kW (258 KM), od 2007