Każda z jednostek operacyjno-taktycznych dysponuje własnym dowództwem, jednakże w zakresie operacyjno-taktycznym w morzu dowodzona jest przez dowództwo wyższego szczebla.

Związki operacyjno-taktyczne Submarine Group 7 Submarine Group 8 Submarine Group 9 Submarine Group 10 Submarine Squadron 3 (SUBRON 3) Submarine Squadron 11 (SUBRON 11) Submarine Squadron 15 (SUBRON 15) Submarine Squadron 17 (SUBRON 17) Submarine Squadron 19 (SUBRON 19) Submarine Squadron 20 (SUBRON 20) Submarine Development Squadron 5

Skład osobowy współczesnej amerykańskiej floty podwodnej stanowi 7 procent składu osobowego US Navy, zaś jej okręty stanowią 25% liczby jednostek bojowych całej floty.

Klasyfikacja i nazewnictwo okrętów Standardowo nazwy wszystkich amerykańskich okrętów składają się z trzech członów: stałego prefiksu określającego przynależność państwową – akronimu USS oznaczającego United States Ship, indywidualnej nazwy jednostki oraz hull number – numeru kadłuba w postaci składającego się z liter i cyfr kodu alfanumerycznego.