Wybór większość członków rady musiał być zatwierdzany przez ministra spraw wewnętrznych.
Od 1839 roku uczelnia miałom prawo przyznawania stopni naukowych: kandydata, studenta, magistra i po zatwierdzeniu przez ministra doktora teologii lub prawa kanonicznego.
Rektorzy 1842–1855 Ignacy Hołowiński 1860–1864 Aleksander Bereśniewicz 1877–1884 Szymon Marcin Kozłowski (doktor honoris causa tej uczelni) 1884–1897 Franciszek Symon 1901–1910 Longin Żarnowiecki 1910–1913 Aleksander Kakowski (także absolwent tej uczelni) 1914–1918 Idzi Radziszewski
Wykładowcy
Wykładowcami Akademii Duchownej w Petersburgu byli m.in.: Czesław Falkowski, Bolesław Hieronim Kłopotowski, Jan Cieplak (adiunkt; wykładał archeologię biblijną, liturgię, teologię moralną i uczył śpiewu kościelnego), Michał Godlewski (kierował Zakładem Homiletyki, a następnie Zakładem Historii Kościoła), Jerzy Matulewicz (kierował katedrą socjologii), Stanisław Trzeciak, Leon Wetmański (pełnił funkcję ojca duchownego).
Studenci
Jej słuchaczami i absolwentami byli m.in. polscy księża: