W sezonie 2012/2013 Czesi ponownie znaleźli się na 7. miejscu klasyfikacji drużynowej Pucharu Świata, tym razem z 1770 punktami. Indywidualnie najlepszym zawodnikiem był Jan Matura. Zakończył sezon na 10. miejscu z 631 punktami. Czterokrotnie stawał na podium: dwukrotnie zwyciężył w Sapporo, a w Harrachovie był drugi i trzeci. Indywidualnie był też dwunasty i piąty na mistrzostwach świata w Val di Fiemme. Z wyjątkiem Matury w Pucharze Świata Czesi zajęli miejsca poza czołową trzydziestką. Dopiero 49. z 40 punktami był, dziesiąty rok wcześniej, Roman Koudelka. Punkty zdobyli też Lukáš Hlava, Antonín Hájek, Čestmír Kožíšek i Jakub Janda.
W 2014 roku na stanowisku trenera kadry Czech zastąpił go Richard Schallert. Jiroutek natomiast, wraz z Matjažem Zupanem, rozpoczął szkolenie reprezentantów Rosji. Schallert to także jego poprzednik na tym stanowisku. W kwietniu 2018 roku został ponownie wybrany przez Czeski Związek Narciarski na głównego szkoleniowca reprezentacji Czech w skokach narciarskich. Zastąpił na tym stanowisku Richarda Schallerta.