W końcu decyzję podjął przewodniczący Libelt – tworząc następujące komisje: galicyjską, złożoną z dwóch sekcji: polskiej – Antoni Helcel, Jerzy Lubomirski, Maurycy Kraiński, Karol Malisz, Feliks Buchwald, Józef Midowicz (członkowie); Wojciech Brandys, Paweł Stalmach (zastępcy) ukraińskiej – Leon Sapieha, Julian Dzieduszycki, Ludwik Stecki, Iwan Borysykewycz, Hryhorij Hynyłewycz, Ołeksa Zakłynśkyj (członkowie); Zenon Pogłodowski, Kasper Cięglewicz, Jerzy Wołoszczak (zastępcy) polską – Jan Chryzostom Janiszewski, Wojciech Cybulski, Jędrzej Moraczewski, Kasper Cięglewicz, Karol Libelt, Ryszard Berwiński (członkowie); Adam Gorczyński, Edmund Chojecki, Kalikst Horoch (zastępcy) słowiańską – członkowie obu komisji oraz dodatkowo Michaił Bakunin (razem 19 osób)
Po wyborze komisji rozpoczęły się długotrwałe spory organizacyjne i regulaminowe, które wywołały nawet zaniepokojenie innych sekcji narodowych, i wezwania o przystąpienie do omawiania programu Zjazdu.