wnuk, także Karol, wykładał na UJ historię sztuki, wnuczka Krystyna Grzybowska (żona profesora prawa Konstantego Grzybowskiego) została pisarką, autorką głównie książek dla młodzieży (a także Kroniki rodzinnej rodu Estreicherów). Szwagrem Karola Józefa był ekonomista krakowski Julian Dunajewski. Jego córka Jadwiga (1859–1946) została żoną nauczyciela Leona Kulczyńskiego.
Życiorys thumb|Karol Estreicher (1904) thumb|Karol Estreicher w loży na „Weselu” Wyspiańskiego, mal. Leon Wyczółkowski, 1905, Muzeum Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie Do 1843 uczęszczał do Gimnazjum św. Anny w Krakowie, następnie studiował na UJ kolejno filologię (1843–1845) i nauki prawne (1845–1848); po studiach podjął pracę w sądownictwie galicyjskim, był aplikantem w Trybunale Cywilnym i Kryminalnym w Krakowie (1848–1855), adiunktem w Sądzie Lwowskim (1855–1862), notariuszem w Sądzie w Wojniczu (1862). W 1862 przeniósł się do Królestwa Kongresowego, do Warszawy, gdzie objął stanowisko zastępcy dyrektora Biblioteki Szkoły Głównej Warszawskiej;