Przed jesiennym sezonem Apertura 2008 Fabián zmienił swój dotychczasowy numer na koszulce, 33, na 8, wolny po odejściu z zespołu José Antonio Olvery. Wziął wówczas udział w turnieju Copa Sudamericana, gdzie w dwóch meczach 1/8 finału z brazylijskim Athletico Paranaense (2:2, 4:3) zanotował po asyście, natomiast w ćwierćfinałowych konfrontacjach z argentyńskim River Plate (2:1, 2:2) po golu. Drużyna prowadzona przez Efraína Floresa odpadła dopiero w dwumeczu półfinałowym po przegranej łącznym wynikiem 0:6 (0:2, 0:4) z brazylijskim Internacionalem. Udane występy zarówno w Copa Sudamericana, jak i w lidze meksykańskiej przełożyły się na zwycięstwo w plebiscycie kibiców na odkrycie sezonu Apertura 2008 w zespole Chivas. 11 stycznia 2009 Fabián zdobył bramkę w zremisowanej 1:1 konfrontacji z Morelią w finale InterLigi, dzięki czemu drużyna Chivas mogła wystąpić w rozgrywkach Copa Libertadores. Tam, ponownie jak przed rokiem, zakończyła jednak swój udział w turnieju już po fazie grupowej.