Ranking zespołów z drugich miejsc Dwa z ośmiu zespołów z drugich miejsc w swoich grupach eliminacyjnych również awansowały do 1/16 finału. Bilansu dokonano na podstawie spotkań z zespołami z pierwszego i trzeciego miejsca w swojej grupie (nie był więc pod uwagę brany mecz z najsłabszym przeciwnikiem). Awans uzyskały Peamount United i Bobruchanka Bobrujsk. GrupaKlubMPkt.MeczeBramkizwy.rem.por.zdob.stra.3 Peamount United 2 3 1 0 1 5 28 Bobruchanka Bobrujsk 2 3 1 0 1 3 14 ŽNK SFK 2000 Sarajewo 2 3 1 0 1 5 47 Łehenda-SzWSM Czernihów 2 3 1 0 1 3 26 Slovan Bratysława 2 3 1 0 1 1 11 ZFK Naše Taksi 2 3 1 0 1 2 35 ŽFK Spartak Subotica 2 3 1 0 1 4 62 SU 1° Dezembro 2 2 0 2 0 1 1
1/16 finału Do 1/16 finału przystąpiło 10 zespołów wyłonionych w fazie wstępnej oraz 22 zespoły z 14 najwyżej notowanych lig (mistrz każdej z nich oraz zespoły z drugich miejsc z pierwszych ośmiu najwyżej notowanych lig). Losowanie par 1/16 finału odbyło się 23 sierpnia 2011 roku. Przy okazji tego losowania ustalone zostały również pary 1/8 finału.