W historii dziennikarstwa rzadko widywałem tak ostre ataki na jakąkolwiek instytucję, którą w prasie powinno się traktować sprawiedliwie, pisał“Straddling Liberalism and Conservatism,” New York Times, 25 March, 2007.

W kwietniu 2005 roku ponownie zakwestionował antykatolickie nastroje w mediach amerykańskich, które przekazywały zniekształcony obraz Josepha Ratzingera, który został papieżem Benedyktem XVI. Groeschel zauważył, że osoba nowego papieża była "bardzo źle wykorzystana przez amerykańskie media", dodając, że biografia papieża z czasów II wojny światowej była negatywnie zniekształcona i że opublikowano błędne raporty dotyczące jego osobowości“New York Catholic Leaders Celebrate the Election of Benedict New York Sun, 20 April, 2005.

W sierpniu 2012 roku w wywiadzie dla religijnej rozgłośni radiowej EWTN stwierdził, że księża dopuszczający się pedofilii po raz pierwszy nie powinni iść do więzienia. Uznał także, że winę za akty pedofilskie ponoszą dzieci, które często prowokują księży"Priest Puts Blame on Some Victims of Sexual Abuse" New York Times, 30 August 2012. Wywołało to natychmiastowe przeprosiny ze strony zakonu franciszkańskiego. Zawierają one cytat z wypowiedzi B. Groeschela, który dystansuje się od swoich stwierdzeń i wyraża przeprosiny.