Andrzej Jan Witkowski (ur. 20 kwietnia 1947 w Szczytnej, zm. 27 września 2017 we Wrocławiu) – polski biolog, specjalizujący się w ichtiologii, zoologii, nauczyciel akademicki.
Życiorys Urodził się w 1947 w Szczytnej, gdzie ukończył szkołę podstawową. Kontynuował naukę w Liceum Ogólnokształcącym im. Bolesława Chrobrego w Kłodzku, które ukończył w 1966. Podjął studia na kierunku biologia na Wydziale Nauk Przyrodniczych Uniwersytetu Wrocławskiego, które ukończył w 1971, otrzymując dyplom z wyróżnieniem magistra biologii ze specjalizacją zoologia. W 1978 uzyskał tytuł naukowy doktora, a w 1984 doktora habilitowanego. W 1990 został mianowany na stanowisko profesora nadzwyczajnego na Uniwersytecie Wrocławskim, a w 1991 otrzymał tytuł profesora.
Pełnił wiele funkcji kierowniczych na swojej macierzystej uczelni. W latach 1987–1990 sprawował funkcję prodziekana ds. dydaktycznych na Wydziale Nauk Przyrodniczych. Od 1990 do 1996 był zastępcą dyrektora oraz kierownikiem (od 1984) Działu Kręgowców Niższych w Muzeum Przyrodniczym. W 1996 objął funkcję prorektora ds. nauczania, którą pełnił do 2002.