W planie gospodarowania wodami na obszarze dorzecza Dunaju na lata 2016–2021 podano, że stan ekologiczny wód jeziora był dobry. Taki sam był stan jego składowych elementów jakości: fitoplanktonu, makrofitów z fitobentosem i ichtiofauny. Stan chemiczny wód był zły.
W 2018 roku na Chiemsee funkcjonowało 13 kąpielisk wyznaczonych zgodnie z przepisami dyrektywy kąpieliskowej. Stan wody w kąpielisku Chiemsee (gemfr. Geb.), Campingplatz Biberspitz sklasyfikowano wówczas jako dobry, podczas gdy na pozostałych jako doskonały. W latach 2012–2015 stan wody we wszystkich kąpieliskach oceniono jako doskonały, podczas gdy w latach 2008–2010 kilku z nim nadano ocenę „dobra lub dostateczna”.
Przyroda i jej ochrona Szuwar jeziora tworzą przede wszystkim trzcinowiska. Na brzegach rosną zarośla zdominowane przez wierzby lub olsze. Nad brzegami występują torfowiska, lasy i tereny użytkowane rolniczo.