pozycję, wyrównując tym samym wyniki Marwitu z poprzednich lat, natomiast Marcin Mikołajewicz z 26 trafieniami na koncie został sklasyfikowany na drugiej pozycji w rankingu najlepszych strzelców ekstraklasy ustępując jedynie Ołeksandrowi Bondarze grającemu w Red Devils Chojnice.
Sezon 2016/2017 był wyjątkowy dla klubu, pomimo nie najlepszego początku (po 5 kolejkach znajdowali się z dorobkiem 3 punktów na 11 lokacie w tabeli), torunianom udało się zdobyć brązowy medal Mistrzostw Polski. Jest to pierwszy medal w historii klubu oraz pierwszy medal w futsalu zdobyty przez klub z Torunia. Po tym sezonie z FC rozstał się również trener Klaudiusz Hirsch, który nie zdecydował się na przedłużenie wygasającego z końcem czerwca kontraktu.
9 czerwca na zwołanej konferencji prasowej, klub przedstawił nowego szkoleniowca. Hirscha na stanowisku trenera zastąpił 34-letni Łukasz Żebrowski, dotychczasowy szkoleniowiec Pogoni 04 Szczecin. Żebrowski do klubu ściągnął etatowego reprezentanta Polski, Tomasza Kriezela, który z miejsca stał się ważnym ogniwem toruńskiego zespołu.