Rozgrywka Worms 2: Armageddon jest strategiczną grą turową, w której gracze na przemian kierują swoimi drużynami, złożonymi z najwyżej czterech dżdżownic, na dwuwymiarowej planszy. Każda tura polega na pokierowaniu przez gracza jedną z dżdżownic należącą do jego drużyny tak, aby zadać jak największe obrażenia robakom z pozostałych drużyn w celu ich wyeliminowania; możliwe są: ruch w lewo lub prawo, skoki oraz użycie jednego rodzaju broni.
Posiadane rodzaje broni mają różne właściwości, np. na lot pocisku z bazooki wpływa kierunek i siła wiatru, granat wybucha z wybranym przez gracza opóźnieniem, a strzelba umożliwia oddanie w ciągu danej tury dwóch niezależnych strzałów. Gra zawiera również wymyślone rodzaje broni, podkreślające jej specyficzny humor, przykładowo superowcę parodiującą Supermana, bombę bananową o wysokiej sile rażenia i święty granat ręczny znany z filmu Monty Python i Święty Graal. Do dyspozycji gracza oddano szereg różnorodnych narzędzi zwiększających mobilność członka drużyny, na przykład linę czy plecak odrzutowy. Użycie części broni powoduje zniszczenia terenu, na którym znajdują się dżdżownice.