Gdy w 1853 ponownie została ustanowiona holenderska hierarchia kościelna, kościół De Krijtberg, wraz z drugim jezuickim kościołem w Amsterdamie, De Saaier, zostały przydzielone do diecezji Haarlem. Ze względu na wciąż powiększającą się liczbę wiernych wkrótce okazało się, że konieczna jest budowa większego kościoła. Zlecenie na tę budowę wydano w 1879. Nowy kościół, dla którego budowy bez wahania zniszczono kilka historycznych domów w Singel i przy Katersteg, został wybudowany w stylu neogotyckim przez Wilhelma Victora Alfreda Tepe (1849–1920) i 3 grudnia 1883 konsekrowany przez ówczesnego biskupa Haarlemu.

Gdy ogólna liczba wiernych i praktykujących katolików spośród ludności Amsterdamu począwszy od lat 1960. zaczęła drastycznie spadać, zaczęto rozważać zamknięcie a nawet wyburzenie kościoła De Krijberg. Jednak gdy w 1974 został on uznany przez władze publiczne za budowlę historyczną i jako taką objętą ochroną zabytków, biskup Haarlemu wycofał swoje plany co do zamknięcia kościoła. W następstwie De Krijberg został w 2003 gruntownie odrestaurowany.