W okresie 16 marca 1979–30 czerwca 1988 załoga Strażnicy WOP Sejny wykonywała bezpośrednio kontrolę graniczną osób i środków transportu, a od 1 sierpnia 1988 nowo utworzonej Granicznej Placówki Kontrolnej Ogrodniki (GPK Ogrodniki): Przejście graniczne Ogrodniki – drogowe (lokalnego znaczenia) – rejon znaku gran. nr 1855.
W roku 1990, długość ochranianego odcinka granicy państwowej Strażnicy WOP Sejny wynosiła ok. 64 km (była obok Strażnicy WOP Gródek, najdłuższym odcinkiem do ochrony w Podlasko-Mazirskiej Brygadzie WOP). Strażnica WOP Sejny sąsiadowała ze Strażnicą WOP Lipsk (jezioro Szlamy – znak gran. nr 1780) i Strażnicą WOP Rutka Tartak (Trompole – znak gran. nr 1915), a od południa ze Strażnicą Odwodową WOP Augustów.
Straż Graniczna: W roku 2002, po stronie litewskiej na długości 102,4 km ochraniał granicę SOGP w Łoździejach.
Wydarzenia 1976 – wycofano z granicy rowery, zastępując je motocyklami małolitrażowymi;