Wcześniej w zakładach Thomas-Morse Aircraft zaprojektowano szereg interesujących konstrukcji – prototypowe MB-1 i MB-2) oraz zaprojektowany jako myśliwiec, choć używany jako samolot szkolny bardzo popularny S-4.
Prace projektowe Głównym projektantem przedsiębiorstwa był B. Douglas Thomas (przypadkowa zbieżność nazwisk, założyciele przedsiębiorstwa, bracia Thomas nie byli z nim spowinowaceni), który wcześniej pracował dla Vickersa i Sopwitha. Zaprojektowany przez niego samolot był konstrukcyjnie bardzo zbliżony do SPAD-a XIII i był całkowicie konwencjonalnym dwupłatem. Samolot miał konstrukcję drewnianą, krytą płótnem i napędzany był pojedynczym silnikiem w układzie ciągnącym. Na trzy tygodnie przed zakończeniem wojny USAAC zamówił cztery prototypy do ewaluacji jako potencjalny samolot myśliwski (numery seryjne od 40092 do 40095).
Testy thumb|right|MB-3 w fabryce Pierwszym oblatanym samolotem był drugi prototyp (40093), oblatany na firmowym lotnisku w Ithace 21 lutego 1919 roku. W czasie testów samolot osiągnął prędkość 168 mil na godzinę (270 km/h) i wspiął się na wysokość 10 tys.