Od 2004 roku jest kierownikiem Katedry Elektroradiologiihttps://gloswielkopolski.pl/prof-julian-malicki-nowa-metoda-leczenia-nowotworow-dopiero-za-kilka-lat/ar/3425013
https://www.ump.edu.pl/komunikat/konkurs-na-stanowisko-stypendysty-magistranta-w-projekcie-ncn, a od 2005 roku profesorem w Uniwersytecie Medycznym w Poznaniu. Jest także profesorem na Wydziale Fizyki UAM w Poznaniu. W latach 2016–2020 był członkiem senatu Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu. W latach 2016–2019 pełnił funkcję konsultanta krajowego w dziedzinie fizyki medycznej.
Jest członkiem wielu towarzystw naukowych, m.in.: Polskiego Towarzystwa Radioterapii Onkologicznej (wiceprzewodniczący 2003-2013), Europejskiego Towarzystwa Radioterapii Onkologicznej (ESTRO, członek zarządu 2003-2005); Polskiego Towarzystwa Fizyki Medycznej (PSMP); Amerykańskiego Towarzystwa Radioterapii Onkologicznej (ASTRO), Latynoamerykańskiego Towarzystwa Radioterapii Onkologicznej (ALATRO), a także Amerykańskiego Stowarzyszenia Fizyków w Medycynie (AAPM). Był członkiem (2004 - 2007) Komitetu Fizyki Medycznej, Radiobiologii i Diagnostyki Obrazowej PAN.