W tym czasie trwały roboty wykończeniowe na przystankach.
Eksploatacja 20 października 2017 odbył się przejazd techniczny z udziałem ministra infrastruktury i budownictwa, prezesa PKP PLK i dziennikarzy, a 7 grudnia oficjalne otwarcie z udziałem wiceministra infrastruktury i budownictwa. 9 grudnia po linii przejechał pierwszy pociąg rozkładowy, którym był TLK Uznam do Zakopanego, a dzień później, wraz z wprowadzeniem nowego rozkładu jazdy, na linii rozpoczął się regularny ruch pociągów.
Bezpośrednio po otwarciu łącznicy, czas przejazdu pociągów dalekobieżnych pomiędzy stacjami Kraków Główny a Kraków Bonarka skrócił się o około 15 minut, jednakże nie wszystkie pociągi dalekobieżne skierowano na nową łącznicę ze względu na dzielenie składów na grupy wagonowe na stacji Kraków Płaszów. W przypadku pociągów osobowych relacji Kraków Główny – Skawina czas skrócił się z 40–45 minut do 22–30 minut, ponieważ niepotrzebne stało się przesiadanie lub zmiana czoła w Płaszowie.
22 marca 2018, ze względu na trwające prace modernizacyjne w krakowskim węźle kolejowym oraz rozpoczęcie prac na linii nr 97 pomiędzy Skawiną a Suchą Beskidzką, zaprzestano ruchu pociągów przez linię nr 624.