W 2009 as-Sistani publicznie poparł modyfikację procedur wyborczych - wyborcy mieli głosować już nie tylko na listę partyjną, ale na konkretnych kandydatów. Ajatollah uważał, że zmiana prawa wyborczego jest konieczna dla skuteczniejszej walki z korupcją, konfliktami wewnętrznymi w elicie władzy i kierowaniu się przez polityków wyłącznie wąskim interesem własnej grupy wyznaniowej lub etnicznej.
As-Sistani żyje w Nadżafie, gdzie spotyka się z odwiedzającymi go wiernymi, odmawia jednak udzielania wywiadów i występów publicznych. Prowadzi natomiast stronę internetową. Wyjątkowo wystąpił publicznie po zajęciu Mosulu przez Państwo Islamskie w czerwcu 2014. Wezwał wówczas czołowych polityków szyickich, by nie dopuścili do objęcia stanowiska premiera Iraku po raz trzeci przez Nuriego al-Malikiego i do rozpadu kraju. Następnie zaapelował również do wszystkich zdolnych do walki mężczyzn irackich, by przyłączyli się do walki z Państwem Islamskim w wojsku, innych siłach bezpieczeństwa lub w jednej z milicji tworzonych przez szyitów;