Hama Amadou był najpopularniejszym kandydatem opozycji. 15 listopada 2016 roku tuż po powrocie do kraju z wymuszonej emigracji został aresztowany pod zarzutem handlu dziećmi, ale sam Amadou nie przyznał się do winy i ogłosił się więźniem politycznym. Mimo to został dopuszczony do wyborów prezydenckich. Przez całą kampanię był pozbawiony wolności. Przeszedł do II tury zdobywając 17,73% głosów w I turze. 16 marca, czyli kilka dni przed II turą wyborów został wysłany do Francji na przymusowe leczenie. W II turze zdobył 7,51% głosów. Dopiero 29 marca, po wyborach, sąd zdecydował się wypuścić Amadou za kaucją.
Wyniki Wstępne wyniki zostały ogłoszone 26 lutego 2016 roku. Prezydent Issoufou zdobył około 48% głosów, więc brakowało mu niecałych 2 punktów procentowych do całkowitego zwycięstwa w pierwszej turze. Aresztowany przywódca opozycji Hama Amadou uplasował się na drugim miejscu zdobywając 17,8% głosów. II turę zaplanowano na 20 marca 2016 roku. Amadou uzyskał o wiele niższy wynik, choć pozostałe komitety wyborcze kandydatów opozycji deklarowały poparcie go.