8 marca wspierający Amadou Seyni Oumarou, który zajął trzecie miejsce w I turze wypowiedział się w imieniu koalicji komitetów partii opozycyjnych (COPA 2016). Ogłosił, że koalicja zbojkotuje wybory i wycofa swoich przedstawicieli z komisji wyborczych. W odpowiedzi Hassoumi Massaoudou, Minister Spraw Wewnętrznych zapowiedział, że druga tura odbędzie się niezależnie od udziału opozycji. Prawnik reprezentujący aresztowanego Amadou ogłosił jednak, że jego klient nadal bierze udział w wyborach.

II tura odbyła się 20 marca. Bojkot opozycji sprawił, że Issoufou wygrał zdobywając 92,5% wszystkich głosów. Frekwencja wyniosła 60%. 22 marca COPA oświadczyła, że oficjalnie uważa wybory za sfałszowane i nie uznaje wyników.

W wyborach parlamentarnych partie wspierające Issoufou zdobyły 118 na 171 miejsc w Zgromadzeniu Narodowym. Opozycja zbojkotowała także pierwsze spotkanie parlamentu.

30 marca 2016 Trybunał Konstytucyjny oficjalnie ogłosił, że Issoufou został wybrany na drugą kadencję.