Od tego czasu poświęca swoją karierę rozpowszechnianiu wiedzy na temat EMDR.

W 1994 roku Francine Shapiro otrzymała od Kalifornijskiego Towarzystwa Psychologicznego Nagrodę za Wybitne Osiągnięcia Naukowe w Dziedzinie Psychologii (Distinguished Scientific Achievement in Psychology Award). W roku 2002 została odznaczona Nagrodą Zygmunta Freuda przez Światowe Stowarzyszenie Psychoterapii i miasto Wiedeń.

Nazwa EMDR jest znakiem zastrzeżonym przez EMDR Institute, Inc. stworzonym przez Francine Shapiro. Organizacja ta odpowiedzialna jest za certyfikowanie terapeutów i dbanie o najwyższe standardy ich nauczania. W Polsce Polskie Towarzystwo Terapii EMDR (PTT EMDR), działające jako krajowy oddział Europejskiego Towarzystwa EMDR, jest ośrodkiem skupiającym terapeutów EMDR i organizującym szkolenia podstawowe i specjalizacyjne w tym podejściu terapeutycznym.