Latem i jesienią przebywają w płytszych wodach, a zimą i wiosną preferują głębsze, otwarte wody.
Biologia i ekologia Żarłacz czarnoskóry jest dominującym drapieżnikiem zajmującym najwyższą pozycję w łańcuchu pokarmowym i odgrywa ważną rolę w ekosystemie morskim. Na obszarze zachodniego Atlantyku jest rzadziej spotykany w porównaniu do innych dużych sympatrycznych gatunków rekinów występujących na tych samych siedliskach, jak choćby żarłacz brunatny (C. plumbeus). Jednakże niekiedy tworzy duże skupiska, zwłaszcza w przypadku młodocianych osobników. Dorosłe osobniki są często obserwowane w pobliżu statków z dala od brzegu, jak na obszarze Prądu Agulhas. Radiowe śledzenie oznakowanych osobników wykazało, że rekin ten w pobliżu ujścia rzeki Cape Fear w Karolinie Południowej pływa ze średnią prędkością 0,8 km/h (0,5 m/s).