W czasach stalinizmu, by uniknąć likwidacji, organizacja stała się częścią Jacht Klubu Polski, który i tak zlikwidowano w 1950. Klub włączono w tej sytuacji w struktury Zrzeszenia Sportowego "Ogniwo". Liczba członków zmalała z 200 do 80. W 1955 utworzono sekcję żeglarską "Sparta" przy Prezydium Miejskiej Rady Narodowej Poznania. Reaktywacja klubu nastąpiła 28 stycznia 1957.
W latach następnych nawiązała się ścisła współpraca z Międzynarodowymi Targami Poznańskimi, co zaowocowało rozgrywaniem prestiżowych zawodów - Międzynarodowego Pucharu Targów Poznańskich. W najlepszych latach puchar gromadził około trzystu zawodników. Na miejscu, własnymi siłami, produkowano jachty - m.in. Słonki, Cadety, Hornety i OK Dinghy.
W 1968 zmodernizowano przystań, zbudowano zaplecze sanitarne i nowe hangary. Stanął też nowy pawilon klubowy. Wszystko to związane było z przygotowaniami do Żeglarskiej Spartakiady Młodzieży. W 1974 dokupiono nową parcelę, na której stanął 60-miejscowy hotel.
Regaty Do tradycji klubowych weszło rozgrywanie Regat Wiosennych o Puchar JKW oraz Memoriału Jacka Sobkowiaka (jesień).