Kompozytor realizował zamówienia twórcze ministerstw kultury Polski, Francji, Nadrenii-Westfalii, Chin, a także Radia France oraz Polskiego Radia.
W latach 2016 i 2018, na zaproszenie Ministerstwa Gospodarki i Kultury Chińskiej Republiki Ludowej, Stańczyk odbył dwie miesięczne podróże po Chinach, gdzie jako reprezentant Polski w programie współpracy Chin z 16 krajami Europy Środkowej i Południowej w międzyrządowym formacie współpracy Chin z krajami europejskimi "16+1" poznawał historię i kulturę "Państwa Środka". Owocem tych doświadczeń był utwór Dancing Dune (2017), zamówiony przez rząd chiński i prawykonany przez Filharmoników Szanghajskich pod dyrekcją Zhou Ke.
Marcin Stańczyk pracuje w Wojewódzkim Sądzie Administracyjnym w Łodzi. Jest profesorem w Akademii Muzycznej w Łodzi, gdzie w 2013 roku otrzymał stopień doktora, a w 2016 roku doktora habilitowanego sztuki. W 2020 roku otrzymał tytuł profesora.. W kadencji 2020–2024 pełnił funkcję Pełnomocnika rektora ds. równego traktowania. Wykładał gościnnie m.in. we Francji, Niemczech, Włoszech, Stanach Zjednoczonych, Wielkiej Brytanii, Izraelu, Chinach, Norwegii i Polsce. Przewodził obradom jury konkursu kompozytorskiego I Ise-Shima International Composition Competition w Japonii (2020). Przez wiele lat był artystą chóru Filharmonii Łódzkiej im. Artura Rubinsteina.