Pełni także funkcję eksperta muzycznego; występuje w roli jurora krajowych i międzynarodowych konkursów muzycznych, działał jako doradca muzyczny (music advisor) zagranicznych fundacji i stowarzyszeń, m.in. Bogliasco Foundation, MA/IN Festival i Tokyo Chamber Music Competition. Występował przed sądami jako biegły sądowy z dziedziny muzykoznawstwa.
W 2025 roku Marcin Stańczyk wraz z Anną Wójcikowską założył Fundację Aleksego Rżewskiego – Pierwszego Prezydenta Łodzi po odzyskaniu przez Polskę niepodległości. Fundacja prowadzi działalność społecznie użyteczną w sferze kultury, nauki i sztuki, ochrony zabytków, dóbr kultury i dziedzictwa narodowego, szkolnictwa wyższego, edukacji, oświaty i wychowania dzieci, młodzieży, dorosłych oraz osób w wieku emerytalnym, integracji społecznej, podtrzymywania i upowszechniania tradycji i kultury narodowej, podejmuje działania na rzecz upowszechniania i rozwoju kultury, nauki i sztuki budujących świadomość narodową, obywatelską i kulturową, w tym rozwój wspólnot i społeczności lokalnych.
Jest członkiem Związku Kompozytorów Polskich, Stowarzyszenia Autorów ZAIKS oraz Polskiego Towarzystwa Muzyki Współczesnej.
Partytury Marcina Stańczyka są wydawane nakładem Polskiego Wydawnictwa Muzycznego.