Wschodni Zarząd Regionalny Swoją siedzibę ma w Charkowie. Obejmuje 1934,5 km granicy, w tym 1541,5 km na lądzie, 261 km na rzekach oraz 132 km na Morzu Azowskim. Granice te przebiegają przez obwody doniecki, ługański, charkowski i sumski. W związku z konfliktem na wschodniej Ukrainie, Służba Graniczna nie kontroluje 461,2 km granicy w obwodach donieckim i ługańskim. Odcinek ten znajduje się pod kontrolą prorosyjskich separatystów. W skład Zarządu wchodzą: Doniecki Zagon Graniczny, Ługański Zagon Graniczny, Charkowski Zagon Graniczny, Sumski Zagon Graniczny, Charkowska Samodzielna Eskadra Lotnictwa, Mariupolski Zagon Ochrony Morskiej, Szpital Wschodniego Zarządu Regionalnego PSGU w Charkowie. Dowódcą Zarządu jest gen. mjr Serhij Bidyło.
Północny Zarząd Regionalny Swoją siedzibę ma w Żytomierzu. Obejmuje 1358,6 km granicy, w tym 985,7 km na lądzie, 370,7 km na rzekach oraz 2,2 km na jeziorach. Są to granice z Polską, Białorusią i Federacją Rosyjską. W jego skład wchodzą: Czernihowski Zagon Graniczny, Żytomierski Zagon Graniczny, Łucki Zagon Graniczny. Dowódcą Zarządu jest gen. mjr Wałerij Kurnikow.