W tym czasie kierował Państwową Komisją Geologiczną.
W 1956, w niejasnych okolicznościach (prawdopodobnie wskutek otrucia) zmarł brat Panajota, Kalo, który pełnił funkcję dyrektora przedsiębiorstwa wydobywczego w Sukthu. W kwietniu 1956 w czasie obrad konferencji Komitetu Okręgowego partii w Tiranie, Plaku należał do inicjatorów wystąpienia przeciwko rządom Envera Hodży. Usunięty ze stanowiska ministra i zagrożony aresztowaniem, 17 maja 1957 uciekł do Jugosławii. Według relacji Serveta Tartariego, pełniącego w tym czasie służbę w Straży Granicznej, przekroczenie dobrze strzeżonej granicy była możliwe dzięki doskonałej znajomości terenu i wiedzy na temat rozstawienia posterunków, którą Plaku posiadał jako minister. W tym samym dniu utracił mandat deputowanego do parlamentu.