W 2012 roku Morris dołączył do akademii lokalnego klubu Seattle Sounders FC. Tam był wyróżniającym się piłkarzem: już w pierwszym sezonie strzelił 28 goli i otrzymał od krajowej federacji piłkarskiej nagrodę dla najlepszego piłkarza rozgrywek młodzieżowych – U-17/18 Development Academy Player of the Year. Zaraz potem zdecydował się jednak odejść z drużyny i rozpocząć studia na Uniwersytecie Stanforda w San Francisco. Karierę piłkarską kontynuował z powodzeniem w tamtejszym zespole Stanford Cardinal. Podczas trzyletniego pobytu w Kalifornii był trzykrotnie (2013, 2014, 2015) wybierany do najlepszej drużyny konferencji Pacific-12 Conference (All-Pac-12 First Team), zaś dwukrotnie (2014, 2015) do drużyny NSCAA First Team All-American. W 2014 roku wygrał z Cardinal rozgrywki Pac-12 Championship. W 2015 roku ponownie triumfował w konferencji Pac-12 (został wybrany najlepszym piłkarzem tych rozgrywek), a także pomógł swojej drużynie wygrać po raz pierwszy CAA Division I Men’s Soccer Championship. Strzelił wówczas dwa gole w finale z Clemson Tigers (4:0), zostając królem strzelców turnieju.