Na drugi dzień został przewieziony w stanie beznadziejnym do szpitala polowego w Rawie Ruskiej (tracił już wówczas przytomność i majaczył). Zmarł w dniu 21 września 1939 o godzinie 10:00, w otoczeniu swych żołnierzy.
Pochowany został na cmentarzu parafialnym w Rawie Ruskiej.
Rodzina Major Jan Witkowski był żonaty, a z jego małżeństwa urodziło się dwoje dzieci: syn Zbigniew (ur. 29 listopada 1924) i córka Danuta (ur. 17 kwietnia 1927).
Awanse 35px podporucznik 35px porucznik (zweryfikowany w tym stopniu został ze starszeństwem z dniem 1.6.1919) 35px kapitan (1.7.1925) 35px major (1.1.1936)
Ordery i odznaczenia Krzyż Srebrny Orderu Wojskowego Virtuti Militari nr 144 (17 maja 1921) Krzyż Niepodległości (9 listopada 1931) „za pracę w dziele odzyskania niepodległości”. Srebrny Krzyż Zasługi (10 listopada 1928)M.P. z 1928 r. nr 260, poz.