Praca dla MSZ thumb|Kowno, ok. 1918 thumb|Budynek w Kownie, w którym od 1920 miała siedzibę Litewska Agencja Telegraficzna (ELTA) W 1918, po ogłoszeniu aktu niepodległości Litwy ukazał się apel rządu o pomoc rodaków przebywających na emigracji w budowaniu państwowości. Avitėnaitė, Bronius Balutis, Tomas Naruševičius przybyli do pracy w litewskiej służbie informacyjnej i dyplomatycznej. Ścieżki życia Magdalen i Mihaia rozdzieliły się całkowicie. Zrezygnowała z osobistego szczęścia i wybrała pracę dla Litwy.
Od 1920 do 1940 pracowała w ministerstwie spraw zagranicznych. W latach 1924–1926 była szefem Litewskiej Agencji Telegraficznej (ELTA), od 1926 szefem biura prasowego, później dyrektorem departamentu prasy i informacji. W czerwcu 1924 reprezentowała Litwę na Międzynarodowej Konferencji Agencji Telegraficznych w Bernie w Szwajcarii, gdzie była jedyną kobietą wśród 33 uczestników. Zorganizowała wystawy, m.in. w Barcelonie, Liège, Sztokholmie, Kopenhadze, Göteborgu, Chicago, Brukseli. W 1937 odpowiadała za pawilon litewski na światowej wystawie w Paryżu pt. Miejsce sztuki i technologii we współczesnym świecie. W 1939 była generalnym komisarzem pawilonu litewskiego na światowej wystawie w Nowym Jorku pt. Świat jutra. Dzięki jej zaangażowaniu wybór eksponatów był niezwykle profesjonalny.