Efekty Ekonometryczna analiza programu boryka się z licznymi trudnościami, takimi jak nielosowy dobór i przebieg edukacji w grupie uczestników i określanej na różne sposoby „grupie kontrolnej”, oraz trudne do zmierzenia efekty zewnętrzne oświaty. Efekty programu oceniane były ponadto na wiele różnych sposobów – np. tylko na podstawie kompetencji twardych, lub z uwzględnieniem miękkich; bezpośrednio po osiągnięciu wieku szkolnego, lub długoterminowo. Przegląd z Brookings Institution zwraca także uwagę, że efekty wsparcia przedszkolnego są mocno zróżnicowane w zależności od szczegółów konkretnej lokalnej implementacji programu – i że do wyciągnięcia rzetelnych wniosków nadal niezbędne są dalsze badania.
Relatywna poprawa w niektórych kryteriach okazała się w analizach opublikowanych w latach 1970–2000. krótkofalowa i zanikająca, kiedy dzieci osiągały wiek młodzieńczy – choć skala tego zjawiska była kwestionowana. Znaczące kontrowersje wywołała krytyczna ocena programu zawarta w The Bell Curve, książce libertariańskiego politologa Ch. Murraya i psychologa R.