W maju 2007 roku sprzeciwił się postanowieniom Białoruskiego Kongresu Sił Demokratycznych, według których zlikwidowano funkcję lidera opozycji i wprowadzono 5 rotacyjnych liderów. Były lider sił opozycyjnych odmówił wejścia do formujących się władz i postanowił skoncentrować się na tworzeniu i rozwijaniu własnego ruchu społecznegoŁukasz Jasina, Tomasz Zawisko, Łukaszenkę zwyciężymy łatwo. Wywiad z Aleksandrem Milinkiewiczem, Kultura Liberalna z 18 czerwca 2012..
3 maja 2010 ogłosił start w wyborach prezydenckich na Białorusi, które miały się odbyć 19 grudnia 2010 rokuAndrzej Pisalnik, Milinkiewicz znowu na prezydenta, rp.pl z 3 maja 2010., później jednak wycofał się, twierdząc, że nie ma zamiaru brać udziału w reżyserowanym przez władze przedstawieniu.
Przez prawie 10 lat stał na czele Ruchu Społecznego „O Wolność”. Był honorowym członkiem Związku Polaków na Białorusi.
10 października 2006 został uhonorowany Nagrodą imienia Sérgio Vieira de Mello za działania na rzecz pokoju. 12 grudnia 2006 otrzymał Nagrodę Sacharowa, przyznawaną osobom i organizacjom szczególnie zasłużonym w walce na rzecz praw człowieka i wolności. 1 grudnia 2007 został laureatem Nagrody im.