NFKBID

Delta jedarni faktor pojačivača kapa lahkog polipeptidnog gena B-ćelija, znan i kao IκBNS, je protein koji je kod ljudi kodiran genom NFKBID.

IκBNS je član nepskih inhibitora NF-κB (koji se nazivaju i jedarni IκB). NF-κB je faktor transkripcije, koji regulira ekspresiju svojih ciljnih gena, ovisno o unutarćelijskim i vanćelijskim signalima. Kako NFKBID utiče na efekte NF-κB na nekoliko gena, uključen je u ćelijske odgovore na podražaje kao što su stres i bakterijski ili virusni antigeni.

Struktura

NFKBID je jedarni protein sa 327 aminokiselina. Sadrži šest ponavljanja ankirina (ANK), koji su okruženi sekvencom jedarnog lokalizacijskog signala (NLS) na N-kraju i kratkim C-krajem. ANK su karakteristični za sve IκB proteine. NLS je dodatni karakteristični strukturni element samo nepskih proteina IκB, koji je odgovoran za lokalizaciju proteina u jedru. Suprotno tome, klasični inhibitori, npr. IκBα i IκBβ, nalaze se u citoplazmi. Još nije dostupna struktura NFKBID visoke rezolucije.

500px|thumb | centar |Shma NFKBID. Sastoji se od šest ankirinskih domena (ANK - plava) i signalne sekvence jedarne lokalizacije (NLS - zelena).

Aminokiselinski sastav Simboli

C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin

1020304050 MEAGPWRVSAPPSGPPQFPAVVPGPSLEVARAHMLALGPQQLLAQDEEGD TLLHLFAARGLRWAAYAAAEVLQVYRRLDIREHKGKTPLLVAAAANQPLI VEDLLNLGAEPNAADHQGRSVLHVAATYGLPGVLLAVLNSGVQVDLEARD FEGLTPLHTAILALNVAMRPSDLCPRVLSTQARDRLDCVHMLLQMGANHT SQEIKSNKTVLHLAVQAANPTLVQLLLELPRGDLRTFVNMKAHGNTALHM AAALPPGPAQEAIVRHLLAAGADPTLRNLENEQPVHLLRPGPGPEGLRQL LKRSRVAPPGLSS

Funkcija

NFKBID djeluje kao inhibitor kaskade NF-κB. Svojim funkcijama, uključujući promociju reakcija zametnih centara i potrebe za imunosupresivnim regulatornim T-ćelijama, NFKBID regulira homeostazu imunskog sistema i ima različite daljnje posljedice na njega. Furthermore, NFKBID influences B cells and plasma cells substantially, concerning their functions and development.

Ekspresija NFKBID je precizno regulirana. Nakon aktivacije NF-κB, netipski IkB inducira transkripcijski faktor. Atipski IkB, zauzvrat, mogu regulirati transkripciju NF-κB, kao induktori ili inhibitori. Suprotno tome, klasični proteini mogu potisnuti samo transkripciju NF-κB. U zrelim T-ćelijama (CD4 +) stimulacija receptora T-ćelija (TCR) može inducirati ekspresiju NFKBID, dok u makrofagu u ovoj aktivnosti djeluju TLR ligandi.

Da bi uticao na transkripciju gena, NFKBID ima neke interakcijske proteinske partnere. Izvješteno je da NFKBID komunicira s p50, koji je podjedinica NF-κB, p52, p65, RelB i c-Rel. NFKBID veže ove proteine samo u jedru, osim za p50, koji se može vezati i u citoplazmi i u jedru.

Istraživanja sugeriraju da osim ovoga, NFKBID može komunicirati i sa homo- i heterodimerima, koji se sastoje od nekih od ovih podjedinica, npr. p50/p50 i p65/p50. Ovisno o ciljnom genu i o tome na koji je protein vezan NFKBID, on može funkcionirati i kao represor i kao aktivator.

500px |thumb| center |Model interakcije NFKBID-a (ljubičasta) sa p50 homodimerom (zelena i plava) vezanim za DNK (crvena). Kompleks je proučavan eksperimentima molekulskog vezanja. Kompleks NFKBID-p50/p50 elektrostatički djeluje s fosfatima DNK okosnice. Zato proteinski kompleks ne može izaći iz jedra. Uglavnom pozitivno nabijena površina NFKBID blizu DNK, blokira razmjenu dimera p50 p50 s drugim dimerama, koji aktiviraju transkripcijske faktore.

Reference

Kategorija:Geni Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 19